Com um histórico de mais de cinco décadas, a Escola de Medicina é reconhecida como um centro moderno e atuante de formação médica. Atenta às inovações metodológicas e tecnológicas, busca a excelência acadêmica por meio de um projeto pedagógico atualizado, baseado em competências. Orientado à formação generalista, articula pesquisa e extensão na perspectiva interdisciplinar e multidisciplinar, dinamizado por um corpo docente experiente. A humanização e qualificação do atendimento médico, em diferentes espaços, é um princípio educativo enfatizado nas práticas de ensino e de aprendizagem, de modo a propiciar ao egresso uma visão ampliada do sistema de saúde e da comunidade na qual atua, com suas características e necessidades.
A estrutura física da Escola de Medicina está localizada no Campus II, no centro da cidade de Passo Fundo, em espaço moderno e adequado para as aulas teóricas, de práticas simuladas (Centro de Simulação Realística), bem como para o estudo individual ou em grupo. Possui biblioteca especializada, laboratórios de informática, auditório e espaços de convivência. Os acadêmicos, ao longo da formação, interagem em diferentes cenários de prática - na rede municipal de saúde, nos ambulatórios e nos hospitais-escolas conveniados, vivenciando a relação teoria-prática desde o início do curso.
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O Centro de Simulação Realística (CSR) é um espaço inovador, que agrega o que há de mais moderno e tecnológico no ensino na área da saúde. Único no interior do Estado, permite o desenvolvimento de habilidades clínicas e o aprendizado em procedimentos médicos por meio de experiências e metodologias que simulam o atendimento real, com modelos de alta fidelidade e softwares de realidade virtual. O CSR é o único Centro instalado em uma Universidade que conta com a certificação da American Heart Association (AHA), no Estado. Essa iniciativa está alinhada à adoção de estratégias para qualificação curricular com a implantação de metodologias ativas de ensino-aprendizagem, diversidade dos cenários práticos, com envolvimento de equipe multiprofissional e transdisciplinar, propiciando um contexto dinâmico, ativo e construtivo.
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A Escola de Medicina da UPF também é acreditada pelos Sistema de Acreditação de Escolas Médicas (SAEME-CFM).